Ван Гаал е човекът, който промотира Иниеста в първия отбор на Барселона в мач от Шампионската лига срещу Брюж на 29 октомври 2002 г. Каталунците спечелиха онзи мач с 1:0 след гол на Хоан Роман Рикелме.
Иниеста още играеше, както за Барселона Б, така и за първия отбор. Историческият му първи гол в цветовете на каталунците дойде при победата с 3:1 у дома над Леванте за Купата, отбелязвайки само три минути след като се появи като резерва.
Началото на доминацията на Барса в Европа. Франк Рийкард изведе каталунците до втория им трофей в най-престижния европейски клубен турнир през 2006-а. Тогава Барса осъществи обрат срещу Арсенал с голове на Ето`о и Белети.
Паметният гол на Андрес Иниеста на 6 май 2009-а завинаги ще остане в историята на Шампионската лига. Барса губеше с 0:1 в Лондон, но великолепното изпълнение на Мозъка бе първата стъпка към требъла.
През 2010 година Барселона имаше трима представители на подиума в анкетата за най-добрия футболист в света. Иниеста бе в присъствието на Шави и победителя Лионел Меси.
Иниеста има три гола срещу големия съперник Реал Мадрид, а първият му дойде през 2011 година в мача за Суперкупата на Испания след асистенция на Меси. Барса спечели с общ резултат 5:4.
Иниеста спечели наградата за най-добър футболист на УЕФА през 2012 година.
Барселона спечели петия си трофей в Шампионската лига през 2015-а, а Иниеста изравни Кларънс Зеедорф, като и двамата, заедно с Шави и Меси, имат по четири трофея в най-престижния европейски клубен турнир.
През декември 2015-а Иниеста спечели 26-ия си трофей с Барселона, изравнявайки рекорда на Шави. В момента Мозъка, заедно с Лео Меси, има 29 спечелени отличия в цветовете на каталунците.
Последното попадение на Иниеста (засега) за Барселона падна при победата със 7:1 над Селтик в Шампионската лига. Голът сложи край на сушата му от седем месеца, като преди това Иниеста се бе разписал срещу Реал Мадрид в Ел класикото на „Бернабеу“.
