Той бе на 13 февруари, 2003-а, в приятелски мач срещу Австралия. По това време Рууни бе най-младият дебютант с националната фланелка, преди Уолкът да подобри постижението му. Този мач обаче завърши с шокираща победа за "кенгурутата" с 3:1 на "Ъптън Парк".
Той падна срещу Македония в квалификациите за евро 2004, а с него Рууни стана най-младият голмайстор в историята на Трите лъва на 17 години и 317 дни.
Тогава Англия се нуждаеше от задължителен успех, за да си гарантира излизане от групите на турнира. Рууни се разписа на два пъти при победата с 4:2, което си остава един от най-силните му мачове с националната фланелка. Преди това тогава той стана най-младият голмайстор на европейски футболни финали, след като вкара и на Швейцария.
Излишно е да се споменава, че Уейн Рууни беше голямата сензация на турнира и цяла Англия очакваше от него да поведе страната към първа европейска титла в историята. Само че ранна контузия сложи край на тази мечта - след като Рууни счупи глезена си Трите лъва паднаха с 5:6 след дузпи от домакините.
Рууни отиде на Световното първенство в Германия контузен и не успя да покаже на какво е способен. Нервите му не издържаха в четвъртфинала (отново срещу Португалия), след като настъпи Рикардо Карвальо, а съотборникът му в Юнайтед Кристиано Роналдо му изпроси червен картон. Англичаните отново паднаха на дузпи.
След като Англия не успя да се класира на Евро 2008, по време на Мондиал 2010 очакванията към тима бяха още по-завишени. Трите лъва обаче скоропостижно се прибраха у дома, а слабото им представяне завърши с нулево равенство срещу Алжир. След края на мача звездата на тима отправи реплика към английските фенове пред телевизионните камери, след което трябваше също така публично да се извинява.
След като пропусна първите два мача от Евро 2012 заради наказание, Рууни се върна точно навреме, за да спаси трите лъва срещу домакина Украйна. Така Англия завърши на първо място в своята група.
Може и да е трудно за вярване, след като Рууни е голмайстор номер едно и държи куп други рекорди с фланелката на Англия, но нападателят има един единствен гол на световни футболни финали. Той нямаше и голяма тежест, след като бе отбелязан при загубата с 1:2 от Уругвай на Луис Суарес по време на Мондиал 2014. В Бразилия Трите лъва останаха последни в групата си, след като преди това паднаха със същия резултат и от Италия.
Срещу Швейцария Рууни излезе вече с капитанската лента и вкара своя 50-и гол са националната фланелка. По този начин той успя там, където Гари Линекер и Джими Грийвс се провалиха, и остави в историята рекорда на сър Боби Чарлтън за голмайстор номер едно в историята на страната.
53-ият гол на Рууни за Англия се оказа и последен. Той падна също от дузпа - за 0:1. Сензацията на Евро 2016 Исландия обаче постигна впечатляващ и заслужен обрат с 2:1, за да нанесе на Трите лъва едно от най-срамните поражения в историята им.